Paragraphs
BMC

Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs

Author
Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs

7. jūnijs, 2024. gads

APP “Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs” (BMC) ir vadošā pētniecības iestāde molekulārajā bioloģijā, biomedicīnā un biotehnoloģijā Latvijā. Kopš dibināšanas 1993.gadā BMC ir izveidojies par spēcīgu zinātnisko centru, kurā tiek veikti gan fundamentālie, gan lietišķie pētījumi trīs galvenajos virzienos: cilvēka ģenētika un slimību izpēte; vēža izpēte; strukturālā bioloģija, biotehnoloģija un virusoloģija.

Pētniecības virzieni un kompetences

Cilvēka ģenētika un slimību izpēte; vēža izpēte; strukturālā bioloģija, biotehnoloģija un virusoloģija

Pētniecības projekti un sasniegumi

BMC kopumā īsteno vairāk kā 50 pētniecības projektus, kas iegūti konkursa kārtībā gan vietējā, gan starptautisko projektu konkursos (t.sk. Horizon 2020 un Horizon Europe), kā arī nodrošina līgumpētījumi izpildi vairāk kā 10 vietējiem un starptautiskajiem uzņēmumiem. Kopējā pētniecības projektu un līgumpētījumu līgumu kopējā summa ir vairāk kā 19 miljoni EUR.

BMC realizē pētniecības projektus visās savas zinātniskās pamatdarbības virzienos gan kā vadošais partneris, gan sadarbībā ar Latvijas un ārzemju zinātniskajām institūcijām. Galvenie sadarbības partneri Latvijā:

  1. Latvijas Universitāte,
  2. Rīgas Tehniskā Universitāte,
  3. Rīgas Stradiņa Universitāte,
  4. Latvijas Organiskās sintēzes institūts,
  5. LU Cietvielu fizikas institūtus un citi.

Pētniecības projektu realizācijas galvenais rezultāts ir jaunas zināšanas, kas tiek izplatītas zinātnisko publikāciju formā. Pēdējo 5 gadu laikā BMC pētnieki ir publicējuši vairāk nekā 350 publikācijas, uz kurām ir vairāk nekā 10 000 atsauces un h5 indekss ir 31, kas ir labāks rādītājs nekā visiem pārējiem Latvijas zinātniskajiem institūtiem. 29% publikāciju ir labākajos 10% žurnālu, lielākā daļa (59%) publikāciju tapušas sadarbībā ar ārzemju partneriem, tai skaitā ar industrijas partneriem (7.5%), kas ir labāks rādītājs nekā vidēji Latvijas zinātniskajos institūtos un universitātēs.

Papildus fundamentāliem un lietišķiem pētījumiem BMC piedalās līgumpētījumu realizācijā gan ar Latvijas, gan ārvalstu pētnieciskajām institūcijām un uzņēmumiem. Piemēram, sadarbībā ar Šveices uzņēmumu tika izstrādāts COViD-19 vakcīnas prototips, savukārt sadarbībā ar SPKC, RTU un BIOR tiek veikts SARS-CoV-2 vīrusa monitorings Latvijas pilsētu notekūdeņos, tādējādi sniedzot epidemioloģiski noderīgu informāciju Nacionālajam veselības dienestam un Veselības ministrijai.

Ilggadējā pētniecība cilvēka genoma jomā ir nodrošinājusi BMC vadošo lomu Latvijas iedzīvotāju genoma datu bāzes (VIGDB) izveidē un uzturēšanā. 2023. g. tiks pabeigta visu paraugu (>40 000) pārvietošana ilgtermiņa uzglabāšanai šķidrajā slāpeklī. VIGDB ir pamats Latvijas līdzdalībai Eiropas iedzīvotāju 1 miljona genomu projektā, kura ietvaros paredzēts noteikt genoma sekvenci 3500 Latvijas iedzīvotāju un izveidot Latvijas iedzīvotāja genoma referenci tālākai izmantošanai precīzijas medicīnā.

Pētniecības infrastruktūra

BMC būtiskākā infrastruktūra ir koncentrēta piecos servisa centros:

  • Šūnu bioloģijas un mikroskopijas servisa centrs;
  • Laboratorijas dzīvnieku servisa centrs;
  • Genoma centrs;
  • Rekombinanto proteīnu biotehnoloģiju servisa centrs;
  • Bioinformātikas servisa centrs.

Šūnu bioloģijas un mikroskopijas servisa centrs apvieno gan pētnieku zināšanas un pieredzi, gan plašas tehniskās iespējas, lai nodrošinātu zīdītāju šūnu kultūru uzturēšanu, raksturošanu, izmantošanu dažādos testos, kā arī jaunu šūnu kultūru iegūšanu. Servisa centra telpas ir atbilstošas biodrošības 2.līmenim un tās sastāv no trīs boksiem – viens bokss paredzēts šūnu kultūrām, kuras ir saņemtas no ATCC, ECACC vai kādas citas šūnu bankas (šūnas raksturotas, sertificētas), otrs bokss paredzēts darbam ar klīnisko materiālu, lai iegūtu jaunas šūnu līnijas, trešais paredzēts darbam ar vīrusveidīgajām daļiņām un nepatogēnajiem vīrusiem. Ar servisa centra piedāvāto pakalpojumu klāstu un kontaktinformāciju var iepazīties šeit - https://biomed.lu.lv/pakalpojumi/servisa-centri/sunu-biologijas-un-mikroskopijas-servisa-centrs/.

Laboratorijas dzīvnieku servisa centrs ir veidots atbilstoši starptautiskajām prasībām eksperimentālajam darbam ar laboratorijas dzīvniekiem.  Servisa centru pamatā veido īpašas tīrības pakāpes telpas 180 m2 platībā, kas ir brīvas no grauzēju specifiskajiem patogēniem (SPF, specific pathogen free). Tīrtelpās ir izvietoti vairāki funkcionāli atšķirīgi un nodalīti telpu kompleksi – karantīna, atsevišķas telpas peļu un žurku izmitināšanai un procedūrām/ķirurģijai, darbam ar imūndeficītām/transgēnām pelēm, kā arī 2. biodrošības līmenim atbilstošas telpas darbam ar infekciozo slimību modeļiem. SPF tīrtelpās grauzēji tiek turēti individuāli ventilējamos sprostos. Ārpus SPF zonas atrodas laboratorijas telpas pētnieciskajam darbam ar dzīvniekiem, kas tiek turēti atvērtajos sprostos. Nepieciešamo mikrobioloģiskās tīrības pakāpi nodrošina individuāli ventilējamo sprostu sistēmas, 2. biodrošības līmeņa lamināri, ūdeņraža peroksīda tvaika sterilizators, iebūvēti divdurvju autoklāvi, sprostu mazgājamā mašīna. Personāla iekļuve SPF zonā tiek nodrošināta caur gaisa dušu, savukārt gaisa tīrību un mikrobioloģisko kontroli nodrošina automatizēta ar HEPA filtriem aprīkota ventilācijas sistēma un rūpīgi izplānota zemspiedienu/pārspiedienu programma. Grauzēju mikrobioloģiskā statusa monitorēšana tik veikta atbilstoši FELASA rekomendācijām (testēšanu veic sertificētas laboratorijas). Ar servisa centra piedāvāto pakalpojumu klāstu un kontaktinformāciju var iepazīties šeit - https://biomed.lu.lv/pakalpojumi/servisa-centri/laboratorijas-dzivnieku-servisa-centrs-2/.

Genoma centrs piedāvā ar ģenētisko izpēti saistītus pakalpojumus un konsultācijas gan vietēja, gan starptautiska mēroga klientiem dažādās ar molekulāro bioloģiju, biotehnoloģiju un veselības aprūpi saistītas nozarēs, nodrošinot uz sadarbību vērstu vidi, kam ir būtiska loma konkurētspējīgu, starpdisciplināru pētījumu realizēšanā dabaszinātnēs kopumā. Vēsturiski Genoma centrs tika nodibināts 2005. gadā ar mērķi sniegt atbalstu un veicināt cilvēka genoma izpēti Latvijā, tomēr gadu gaitā Genoma centra augsti kvalificētais personāls un tā pārvaldībā esošās modernās tehnoloģijas ir veicinājuši virkni veiksmīgu gan vietēja mēroga, gan starptautisku sadarbību (t.sk. Latvijas bērnu ļaundabīgo audzēju iniciatīva, 1+ Miljons Genomu iniciatīva). Sekmīgu Genoma centra darbību šobrīd nodrošina Latvijas Nacionālā Biobanka un Molekulārās ģenētikas laboratorija, kas turpina paplašināt savu kompetenču un piedāvāto pakalpojumu klāstu.  Ar servisa centra piedāvāto pakalpojumu klāstu un kontaktinformāciju var iepazīties šeit - https://biomed.lu.lv/pakalpojumi/servisa-centri/genoma-centrs-2/.

Rekombinanto proteīnu biotehnoloģiju servisa centrs piedāvā rekombinanto proteīnu ražošanu, izmantojot piemērotu ekspresijas sistēmu,  producenta kultivēšanas apstākļu optimizāciju un attīrīšanas protokolu izstrādi. Imunoloģiski svarīgu proteīnu un vīrusveidīgo daļiņu (VLP) iegūšanai lielākoties tiek izmantotas dažādas E.coli ekspresijas sistēmas, bet BMC izmanto arī dažādu raugu ekspresijas sistēmas. Ar servisa centra piedāvāto pakalpojumu klāstu un kontaktinformāciju var iepazīties šeit - https://biomed.lu.lv/pakalpojumi/servisa-centri/rekombinanto-proteinu-biotehnologiju-servisa-centrs/.

Bioinformātikas servisa centrs nodrošina nākamās paaudzes sekvencēšanas un populācijas mēroga genotipēšanas datu analīzes, lai arī filoģenētiskās un proteīnu mikrorindu datu analīzes arī tiek regulāri veiktas. Šī servisa centra galvenais mērķis ir nodrošināt atbalstu lielapjoma datu analīzei un izplatīt ar šo jomu saistītās zināšanas ne tikai BMC pētniekiem, bet arī zinātniekiem citās Latvijas pētnieciskajās iestādēs. Ar servisa centra piedāvāto pakalpojumu klāstu un kontaktinformāciju var iepazīties šeit - https://biomed.lu.lv/pakalpojumi/servisa-centri/bioinformatikas-servisa-centrs/.

Vadošie zinātnieki

Vārds

Uzvārds

Grāds

h-indekss (Scopus)

ORCID vai Web of Science ResearcherID

Jānis

Kloviņš

PhD

38

0000-0001-8362-5505 (ORCID)

Jekaterina

Ērenpreisa

Dr. biol.

33

COE-4203-2022 (Web of Science ResearcherID)

Kaspars

Tārs

PhD

30

0000-0001-8421-9023 (ORCID)

Aija

Linē

Dr. biol.

25

0000-0002-8492-4758 (ORCID)

Andris

Kazāks

Dr. biol.

21

0000-0003-4964-0984 (ORCID)

Andris

Zeltiņš

Dr. biol.

20

AAI-1017-2021 (Web of Science ResearcherID)

Dāvids

Fridmanis

Dr. biol.

18

0000-0003-0310-0448 (ORCID)

Inna

Iņašķina

Dr. biol.

15

0000-0002-7560-797X (ORCID)

Zane

Kalniņa

Dr. biol.

15

0000-0001-9002-3131 (ORCID)

Vita

Rovīte

Dr. biol.

13

DXG-4701-2022 (Web of Science ResearcherID)

Renāte

Ranka

Dr. biol.

13

0000-0002-3716-7950 (ORCID)

Artūrs

Ābols

Dr. biol.

10

CBP-5336-2022 (Web of Science ResearcherID)

Anna

Zajakina

Dr. biol.

9

0000-0002-4753-1103 (ORCID)

Ina

Baļķe

Dr. biol.

9

0000-0002-5171-7744 (ORCID)

Vairāk informācijas: biomed.lu.lv